Действие происходит в 71 году Космической Эры. Колония Гелиополис сохраняет нейтралитет в конфликте между Координаторами — людьми с изменёнными до рождения биологическими характеристиками — и Натуралами, не подвергавшимися модификации. Натуралы испытывают глубокую неприязнь к Координаторам, что вынудило последних переселиться в искусственные колонии в космосе. Кира Ямато, Координатор и студент университета на Гелиополисе, оказывается в центре событий, когда военная организация ZAFT, состоящая
В недалеком будущем человечество достигло возможности полной замены биологических частей тела на механические аналоги. Эта технология позволяет значительно улучшить физические и кибернетические способности человека, стирая границы между органическим и искусственным. Криминальные элементы также активно используют подобные разработки, что приводит к появлению новых, более опасных видов преступлений. В ответ на эти угрозы японское правительство создает Section 9 - независимое полицейское
В 2012 году на территорию Японии проникли Мю — человекоподобные существа с голубой кровью, прибывшие из другого измерения. В 2015 году эти захватчики предприняли атаку на Токио, однако были вынуждены отступить после применения гуманоидного оружия, известного как «долем». Главный герой, Аято Камина, встречает свою одноклассницу Рэйку Мисиму. В тот же день на него совершают нападение люди, представляющие правительственные структуры. На помощь Аято приходит женщина по имени Харука Сито, которая
Курапика воссоединяется с Гоном и его друзьями, после чего объясняет им риски, связанные с его способностями. Он полагает, что его цель мести больше не жива, и можно начать поиски глаз его павшего товарища. Вскоре Курапика получает сообщение о том, что все члены Пауков всё ещё живы. После обсуждения с друзьями Гон, Курапика и их группа принимают решение охотиться на одного из членов Пауков, чья способность может привести к поражению и смерти Курапики. Сюжет основан на манге Ёсихиро Тогаси.