События разворачиваются на вымышленном острове Саутерн Кросс. Главный герой, Такуто Цунаси, попадает на берег острова ночью, переплыв с материка. После этого он поступает в среднюю школу Южного Креста на первый курс, где заводит новых знакомых. Вскоре выясняется, что остров хранит тайну, связанную с гигантскими роботами, известными как Сайбади. Эти машины активируются только в определенных условиях, и их использование связано с загадочной организацией, которая стремится получить контроль над