A.I.C.O.: Инкарнация

В 2035 году на японском исследовательском объекте происходит инцидент, названный "Взрывом". В результате возникает "Материя" — субстанция, способная к быстрому распространению, поглощению и самовоспроизведению. Материя проникает через остатки плотин и военных объектов в ущелье Куробе. С ней сражаются отряды, задача которых — не допустить её попадания в океан, а также наёмники, пытающиеся выяснить правду о её происхождении.

Айко Татибана находится под постоянным медицинским наблюдением после спасения из Материи. Она проводит время, выздоравливая, складывая бумажные самолётики. Её повседневную жизнь в школе нарушает появление нового ученика Юи Кандзаки. Он указывает на несоответствия, связанные с её телом: почему она не получает травм и почему внезапно перестала нуждаться в инвалидной коляске. Кандзаки утверждает, что её существование отличается от того, что ей рассказывали, и что именно она может остановить "Взрыв". Различные группы проявляют интерес к Айко. Вместе с Кандзаки она вынуждена искать союзников и отправиться в опасное путешествие в центр заражённого ущелья, чтобы избежать окружения. Им предстоит противостоять Материи — врагу, который ведёт себя подобно жидкости.