Дигимон: Дьяволомон наносит ответный удар

События разворачиваются после завершения второго фильма. В компьютерных системах по всей Японии начинает появляться необычный значок. Этот символ распространяется не только на компьютеры, но и на телевизоры, мобильные телефоны и видеоигры — все устройства с экраном и доступом в интернет. Значок оказывается связан с поиском Ягами Таити и Исиды Ямато, которые ранее одержали победу над противником. Выясняется, что изображение принадлежит Диабломону — дигимону вирусного типа, побеждённому во втором фильме. В этот раз Диабломон приобрёл способность становиться физическим и отправляет тысячи своих копий в реальный мир.

Коуширо и Кэн Итидзёдзи разрабатывают план по окончательному уничтожению вируса. Для его реализации требуется участие всех Предначертанных — как прошлых, так и настоящих. Ситуация превращается в гонку со временем, направленную на срыв заговора Диабломона. Однако истинные цели противника скрыты за видимыми действиями. Возрождение Омегамона может оказаться достаточным для повторной остановки Диабломона, но миллионы копий создают серьёзную угрозу. Предначертанным предстоит столкнуться с новыми техниками и неизвестными ранее видами дигимонов. Исход борьбы определит судьбу Токио, который находится под угрозой разрушения.