Стальная тревога! Новый рейд

События второго сезона происходят через два месяца после инцидента на подводной лодке «Туата Де Дананн». Организация «Мифрил» получает информацию о существовании секретной группировки, владеющей технологией взлома системы электронных замков ECS. Эта группировка, называющая себя «Амальгама», использует «тёмную технологию», полученную от «виспера» — человека с особыми способностями, аналогичного Канамэ Тидори. Как и другие секретные службы, «Амальгама» стремится расширить своё влияние.

Миссия Сосукэ Сагары по защите Тидори отзывается «Мифрилом». После этого действия всех сторон — «Мифрила», «Амальгамы» и их противников — начинают складываться в последовательность, ведущую к реализации плана «Амальгамы». Развитие сюжета строится на взаимодействии нескольких организаций, каждая из которых преследует свои цели, используя технологии и людей с особыми способностями.