Призрак в доспехах 2: Невинность

После событий первого фильма прошло несколько лет. Подразделение «9-й Отдел» продолжает свою деятельность. Киборгизированный полицейский Бато вместе с партнёром Тогусой получают задание расследовать серию убийств. Преступления совершаются прототипами гиноидов — андроидов женского типа, которые после выполнения задачи самоуничтожаются. Убийства происходят в разных местах, и каждый раз гиноид исчезает, не оставляя следов.

В ходе расследования один из гиноидов перед самоуничтожением обращается к Бато с просьбой о помощи. Это событие заставляет полицейских пересмотреть свои методы работы. Параллельно с расследованием выясняется, что исчезновение «Майора» Мотоко Кусанаги — бывшего лидера отдела — может быть связано с этими убийствами. Бато и Тогусе предстоит выяснить, кто стоит за созданием гиноидов и какова истинная цель их использования.