Действие происходит в 71 году Космической Эры. Колония Гелиополис сохраняет нейтралитет в конфликте между Координаторами — людьми с изменёнными до рождения биологическими характеристиками — и Натуралами, не подвергавшимися модификации. Натуралы испытывают глубокую неприязнь к Координаторам, что вынудило последних переселиться в искусственные колонии в космосе. Кира Ямато, Координатор и студент университета на Гелиополисе, оказывается в центре событий, когда военная организация ZAFT, состоящая
В недалеком будущем человечество достигло возможности полной замены биологических частей тела на механические аналоги. Эта технология позволяет значительно улучшить физические и кибернетические способности человека, стирая границы между органическим и искусственным. Криминальные элементы также активно используют подобные разработки, что приводит к появлению новых, более опасных видов преступлений. В ответ на эти угрозы японское правительство создает Section 9 - независимое полицейское
В 2012 году на территорию Японии проникли Мю — человекоподобные существа с голубой кровью, прибывшие из другого измерения. В 2015 году эти захватчики предприняли атаку на Токио, однако были вынуждены отступить после применения гуманоидного оружия, известного как «долем». Главный герой, Аято Камина, встречает свою одноклассницу Рэйку Мисиму. В тот же день на него совершают нападение люди, представляющие правительственные структуры. На помощь Аято приходит женщина по имени Харука Сито, которая
Сюдзи и Тисэ — выпускники старшей школы в Хоккайдо. Оба отличаются застенчивостью, поэтому вместо того, чтобы начать романтические отношения, они обмениваются дневниками. Через записи они пытаются наладить общение, но делают это неумело и неловко. Внезапно Саппоро подвергается вражескому налёту. Во время хаоса Сюдзи видит Тисэ, которая использует огромные орудия, встроенные в её тело. Она сбивает истребители противника один за другим. Выясняется, что Тисэ не является обычной девушкой — её сила