Decades into the future, humanity is under siege by an alien race known as the Novas. These inhuman beings leave devastation in their wake whenever they appear, with the efforts to stave them off becoming known as Nova Clashes. Young women known as "Pandoras" and young men known as "Limiters" are implanted with stigmata to give them superhuman powers and are trained in military academies, where they must learn to work together if humanity is to have a chance of surviving.

Люди Икс — команда наделённых суперсилой мутантов, которые были собраны профессором [character=40820]Чарльзом Ксавьером[/character] для защиты простых смертных. Однако общество не признаёт «выродков», и ученики профессора вынуждены спасать тех, кто готов перегрызть им глотку. После гибели одного из своих членов команда прекращает свою деятельность. Спустя год профессор получает известие о таинственном исчезновении в Японии девочки-мутанта. Подозревая, что за этим стоит нечто большее,

Действие сериала происходит в 1924 году в альтернативной Европе в Совилле, небольшом европейском княжестве, сокрытом от посторонних глаз Альпами. Кадзуя Кудзё [久城 一弥], студент по обмену из Японии и младший сын из семьи потомственных военных, обучается здесь в престижной Академии Святой Маргариты. В академии очень популярны городские легенды и разнообразные страшилки, на большую часть которых Кадзуя не обращает никакого внимания, но история о «Королеве Бэрри», таинственном корабле-призраке,